Estrogen merupakan hormon reproduksi utama perempuan.

Estrogen ditemukan pada beberapa pil KB dan umum digunakan oleh perempuan yang sudah mengalami menopause untuk menstabilkan hormon mereka.

Untuk transgender (transwomen), laki-laki yang ingin transisi ke perempuan, estrogen populer digunakan sebagai hormon pengganti.

Transwomen yang pada awalnya seorang laki-laki biasanya akan direkomendasikan oleh dokter untuk mengambil suplemen estrogen.

Pengambilan suplemen estrogen bertujuan agar tubuh dapat mengadopsi karakterisitik yang lebih mendekati perempuan untuk mempermudah transisi dari laki-laki menjadi perempuan.

Estrogen akan menyebabkan perubahan baik internal maupun eksternal pada tubuh laki-laki, meskipun banyak diantara transwomen yang memilih untuk tidak melakukan perubahan kelamin setelah mengambil estrogen.

Mengambil estrogen sebagai bagian dari terapi sulih hormon juga digunakan untuk memudahkan transisi tubuh saat dilakukan perubahan kelamin.

Selain itu, dokter mungkin juga akan meresepkan sejumlah estrogen yang sangat kecil bagi laki-laki untuk mengurangi penyebaran kanker tertentu dan untuk meningkatkan produksi sperma.