Di dalam ASI terdapat komponen oligosakarida yang merupakan komponen terbesar ketiga setelah laktosa dan lemak. Oligosakarida ini memiliki peran vital dalam menciptakan sistem pencernaan yang sehat dan mendorong terjadinya dominasi bakteri yang baik disaluran cerna.
Hasil penelitian yang dilakukan oleh Clemens di Bangladesh pada tahun 1992, yang dipublikasikan di Journal of Pediatrics membuktikan bahwa bayi yang mendapat ASI eksklusif mengalami penurunan risiko shigellosis (infeksi bakteri saluran cerna yang menyebabkan diare kronis) hingga 52% dibanding bayi yang tidak mendapatkan ASI atau bayi yang mengkonsumsi susu formula. Penelitian Clemens ini dilakukan pada kelompok anak anak yang rentan infeksi saluran pencernaan. Penelitian ini memperkuat fakta bahwa ASI merupakan perlindungan utama bagi bayi terhadap penyakit infeksi, terutama infeksi saluran cerna.
