Gejala yang hampir selalu ditemukan adalah demam, penurunan kesadaran, dan kuduk menjadi kaku. Pada bayi, gejalanya sering tidak khas berupa demam, suhu justru turun, lemas, sulit minum, muntah, diare, sesak napas, kejang, dan/ atau ubun-ubun besar membonjol. Pada anak lebih besar, anak mengalami demam, nyeri kepala, mual, muntah, kebingungan, dan lemah. Gejala kaku kuduk ditemukan pada 75% anak. Akhirnya anak dapat meninggal. Kematian terjadi pada 10-80% anak, tergantung umur anak, penyebab, kecepatan pengobatan dan lain-lain. Di antara kasus yang hidup, sebanyak 50-80% mengalami kecacatan berupa kelumpuhan, gangguan pendengaran dan lain-lain.